| 年度 | 项目名称 | 项目来源 | 负责人 |
| 2000 | 儿童鼻咽部肺炎球菌带菌和耐药的研究及监测网络的建立 | 国家自然科学基金项目 | 杨永弘 |
| 2000 | 小儿外科基础及临床研究 | 首都医学发展基金项目 | 李仲智 |
| 2000 | 儿童致病细菌抗生素耐药监测及耐药菌株数据库建立 | 北京市自然基金 | 胡翼云 |
| 2000 | 儿童白血病心理治疗模式和社会医学保障模式研究 | 北京市科委课题 | 郑胡镛 |
| 2000 | 组织相容性复合体—I类、II类基因与I型糖尿病易感性及临床状态异质性的联合研究 | 北京市科技新星计划 | 桑艳梅 |
| 2000 | 腹部压力的变化对腹部静脉回流及心功能影响的探讨 | 教育部留学回国人员科研基金 | 张钦明 |
| 2001 | 空肠弯曲菌DNA对大鼠坐骨神经的影响 | 教育部留学回国人员科研基金 | 邹丽萍 |
| 2001 | 儿童泌尿道畸形的临床研究 | 北京市跨世纪人才工程 | 孙 宁 |
| 2002 | n-3甘油三酯丰富颗粒代谢清除机制研究 | 国家自然科学基金项目 | 齐可民 |
| 2002 | 脾大部切除移位于不同部位治疗肝前型门脉高压实验研究 | 科技部攻关课题 | 陈亚军 |
| 2002 | 儿科社区呼吸道感染常见病原菌耐药的分子流行病学监测 | 国家自然科学基金项目 | 杨永弘 |
| 2002 | 儿科社区呼吸道感染常见病原菌耐药的分子流行病学监测 | 首都医学发展基金项目 | 沈叙庄 |
| 2002 | n-3甘油三酯丰富颗粒代谢清除机制探讨 | 教育部留学回国人员科研基金 | 齐可民 |
| 2002 | 儿童百日咳诊断方法及百日咳感染的流行病学研究 | 教育部留学回国人员科研基金 | 沈叙庄 |
| 2003 | 儿童疾病预防知识普及现状与对策研究 | 科技部软科学课题 | 李仲智 |
| 2003 | 小儿肺炎的细菌病原及其耐药性的研究 | 科技部攻关课题 | 杨永弘 |
| 2003 | 儿童急性淋巴细胞白血病基因分型的临床研究 | 科技部攻关课题 | 吴敏媛 |
| 2003 | 轮状病毒在小儿肠套叠发病中作用的分子流行病学研究 | 国家自然科学基金项目 | 李仲智 |
| 2003 | B族链球菌实验性结合疫苗的制备及粘膜免疫研究 | 国家自然科学基金项目 | 沈叙庄 |
| 2003 | 小儿SARS感染特点的研究 | 北京市专项基金 | 杨永弘 |
| 2003 | 儿童青少年糖尿病病因及分类治疗管理系列研究 | 首都医学发展基金项目 | 巩纯秀 |
| 2003 | 北京地区儿童睡眠呼吸障碍的临床研究 | 首都医学发展基金项目 | 申昆玲 |
| 2003 | 婴儿痉挛症发病机制及治疗的研究 | 首都医学发展基金项目 | 邹丽萍 |
| 2003 | 川崎病冠状动脉并发症的危险因素估测、早期诊断和临床干预 | 首都医学发展基金项目 | 杜忠东 |
| 2003 | 复幼合剂治疗女童性早熟的临床研究 | 首都医学发展基金项目 | 刘慧丽 |
| 2003 | 鱼腥草注射液雾化吸入治疗呼吸道合胞病毒感染的实验及临床研究 | 卫生部科研基金项目 | 申昆玲 |
| 2003 | 儿童系统性红斑狼疮疾病相关基因单核苷酸多肽性研究 | 北京市自然基金 | 李彩凤 |
| 2003 | 小儿下尿路梗阻尿流动力学改变与上尿路损害的关系 | 北京市科技新星计划 | 谢向辉 |
| 2004 | 抗生素在儿科使用状况和细菌耐药性检测研究 | 科技攻关计划课题 | 沈叙庄/杨永弘 |
| 2004 | 儿童肺炎细菌病原学及其耐药性研究 | 北京市科委项目 | 杨永弘 |
| 2004 | 婴儿先天性心脏病分子发病机制及围手术期的脑损伤保护的基础和临床研究 | 北京市科委项目 | 李仲智 |
| 2004 | 小儿结核分支杆菌基因诊断、耐药机制及分子流行病学研究 | 国家自然科学基金项目 | 申阿东 |
| 2004 | 母体抗体在婴儿痉挛形成机制中的作用 | 北京市自然基金 | 邹丽萍 |
| 2004 | 小儿肺炎的细菌病原及其耐药性的研究 | 北京市科技新星计划 | 王亚娟 |
| 2005 | 感染性休克时胃粘膜二氧化碳分压的实验与临床应用研究 | 北京市自然基金 | 曾健生 |
注： 以上项目仅限科研处存档统计
